Les immunodéprimés sont la clé de l'identification d'Omicron : les experts de l'IDSA

Par Damian McNamara, MA

3 déc. 2021 -- Même si les responsables attendent plus d'informations sur les dangers de la variante du coronavirus Omicron, une action immédiate qu'ils recommandent est de donner la priorité au séquençage génétique des échantillons de virus positifs, en particulier chez les personnes immunodéprimées.

Certains experts pensent qu'une personne immunodéprimée a été infectée, ce qui a laissé suffisamment de temps et d'opportunités au grand nombre de mutations du virus pour créer la nouvelle variante.

"Ce qui rend Omicron particulièrement inquiétant, c'est le fait qu'il présente un grand nombre de mutations", a déclaré le docteur Carlos del Rio lors d'un point de presse organisé jeudi par l'Infectious Diseases Society of America (IDSA). "Il semble que ce soit un virus qui a émergé chez un seul patient, probablement quelqu'un qui était sévèrement immunodéprimé et qui n'a pas pu éliminer cette infection.

Ainsi, en plus de mieux vacciner le monde, "nous devons également nous préoccuper davantage de nos patients immunodéprimés, car c'est peut-être chez eux que le virus continue de muter", a déclaré M. Del Rio, professeur de santé mondiale et d'épidémiologie à l'université Emory d'Atlanta.

M. Del Rio s'appuie sur ses collègues des maladies infectieuses et de la médecine des transplantations pour signaler les patients immunodéprimés dont le test de dépistage du coronavirus est positif.

"Pas plus tard qu'hier, nous avons eu dans notre hôpital un patient séropositif atteint du COVID. Immédiatement, le consultant de l'équipe a dit : 'Demandons au laboratoire de référer cet [échantillon] pour une surveillance génétique' ", a-t-il déclaré.

C'est la saison des tests ?

Les responsables de la santé publique redoublent d'efforts face aux nombreuses inconnues concernant Omicron, a déclaré Julie Vaishampayan, MD, MPH, lors du briefing.

"Nous avons simplement besoin de plus de science et d'informations", a-t-elle déclaré.

La santé publique augmente les tests, le séquençage du génome entier, l'investigation des cas et la recherche des contacts lorsque des cas sont identifiés.

Ces mesures sont urgentes à l'approche de l'hiver, lorsque le temps froid incite les gens à rester à l'intérieur.

"Nous sommes à la période de l'année... où les virus respiratoires se développent", a déclaré M. Vaishampayan, agent de santé publique du comté de Modesto, en Californie. .

Chaque Américain peut également faire sa part, a-t-elle ajouté. Mme Vaishampayan a recommandé aux gens de mettre en place des couches supplémentaires de protection. Envisagez de faire plus de tests, de porter des masques dans tout espace public où vous ne connaissez pas le statut vaccinal de chacun, et "faites-vous vacciner contre la grippe, s'il vous plaît".

Del Rio est d'accord. "Nous devons faire plus de tests. Je pense que les tests ont beaucoup diminué aux États-Unis."

M. Vaishampayan ne recommande pas aux gens d'annuler leurs réunions de vacances.

"Je ne dis pas de changer vos plans. Je vous dis de regarder très attentivement ce que vous prévoyez de faire, et peut-être d'ajouter quelques couches supplémentaires."

Le séquençage américain s'est beaucoup amélioré

Del Rio a déclaré que la détection rapide d'Omicron en Afrique du Sud illustre la nécessité d'exercer une surveillance active des variantes nouvelles et circulantes aux États-Unis également.

Le séquençage génomique des échantillons positifs s'est considérablement amélioré aux États-Unis, a-t-il ajouté. " Nous étions très en retard en matière de surveillance génomique aux États-Unis en 2020. Nous avons fait un bien meilleur travail cette année".

On estime que 5 à 7 % des échantillons positifs sont séquencés à l'échelle nationale, a indiqué M. del Rio, grâce à un réseau de laboratoires universitaires, privés et de santé publique. En outre, selon M. Vaishampayan, un échantillon positif sur sept en Californie est soumis à un séquençage génomique complet.

L'université Emory collabore avec les CDC et le département de la santé de Géorgie pour effectuer une surveillance virale, par exemple.

"En fait, nous travaillons actuellement à l'amélioration de la surveillance génomique autour des patients immunodéprimés, car c'est exactement l'une des préoccupations que beaucoup ont", a déclaré del Rio.

Ne négligez pas Delta

Alors que ce que l'on sait et ce que l'on ne sait pas sur Omicron continue de faire les gros titres et de retenir l'attention de nombreux responsables de la santé, "n'oublions pas Delta, notre problème actuel", a déclaré del Rio.

Près de 100 000 personnes sont nouvellement diagnostiquées chaque jour avec le COVID-19 aux États-Unis, environ 5 000 personnes sont hospitalisées, "et nous comptons environ un millier de personnes qui meurent du COVID, encore, dans notre pays chaque jour", a-t-il déclaré.

La vaccination reste la priorité numéro un. "Avec la circulation de Delta en ce moment, je dis aux gens qu'ils vont rencontrer Delta à un moment ou à un autre", a déclaré M. del Rio. "Si c'est le cas, il est préférable d'être vacciné que de ne pas l'être".

"Ce n'est pas différent de dire que vous allez rencontrer un accident de la route à un moment donné, et qu'il vaut mieux porter votre ceinture de sécurité que de ne pas en porter", a-t-il ajouté.

"Nous avons toujours un problème majeur avec Delta", a ajouté M. del Rio. "Cela dit, vous savez, Omicron arrive."